中英聯合聲明指出，船舶註冊事宜將繼續由香港特別行政區負責執行。為確保在殖民地年代註冊的船舶能順利在香港回歸後繼續運作，當局為此制定新的船舶註冊制度，而非延續舊有的註冊制度或在1997年後作出變動。從1990年到1997年回歸前，於香港註冊的船舶均被視為英國船隻。

早在1990年，海事處便負責推廣香港船舶註冊處，並滿足船運業對有效船舶註冊體系的需求。當局重新審視了船舶註冊和貸款程序，一方面改良既有做法，另一方面訂定新法規。申請註冊的文件會集中送往海事處的註冊中心，中心設有現代化的通訊設備，可與世界各地即時通訊。擬在香港註冊的船舶，構造與設備必須符合國際標準，才能通過註冊審核；海事公約採用的標準亦繼續適用於香港船舶。此外，香港須執行公約衍生的所有義務，並積極參與國際海事組織的工作。

香港船舶註冊處

香港船舶註冊處於1990年12月3日成立，迅即受到本地和海外船東歡迎，當時的船舶註冊總噸位(Gross Registered Tonnage (GRT))已經高達644.6萬噸。其後船舶註冊總噸位不斷攀升，至1996年5月達到910萬噸。

提高註冊噸位 ── 檢討與發展^[4]

由於船舶註冊總噸位在1997年曾一度下跌，海事處為此展開多項研究以查找原因。1997年香港回歸，政治前景不明朗，令許多船東趕在1997年前把香港註冊船隻改換為到其他船旗國註冊。1997年底，註冊處的總噸位量創下歷史新低，僅剩下約540萬噸。即使香港回歸後社會的不安情緒得以紓緩，但船舶註冊量數年來持續低企。為了扭轉劣勢，海事處於1999年在諮詢本地航運業界後，在香港船舶註冊處實行一系列改良措施。這次改革得到本地船東支持，更吸引大量大中華地區的重要船東前來註冊。自此至2005年，香港船舶註冊處的船舶註冊噸位量每年持續以20%增長，並從1999年的640萬噸增至2015年9月的超過1億噸，增長超過15.6倍。

1999年採用船旗國品質管理系統^[5]

每個船旗國都有責任確保其註冊船隻嚴格遵守所有適用的國際公約和該國的規定。大部分船旗國都依靠獲授權的船級社作為認可機構，代表他們檢驗船舶。許多船旗國會定期自行檢驗旗下船隻，以確保船舶的質素和認可機構的表現。海事處在香港船舶註冊處於1999年改革前也是採用此法，同時每五年為香港註冊船隻作品質檢查。

後來海事處發現，若要以更開放和更全面的方式執行船旗國的監督工作，就必須把所有負責監管船舶品質的持份者的表現納入考量因素。這些關鍵角色包括認可組織、管理公司和船員。經過審慎考量後，當局認為如由海事處負責整體監督香港註冊船舶的品質，可以更有效善用資源，海事處於是在1999年採用船旗國品質管理系統。

海事處驗船人員會抽樣對香港註冊船舶進行船旗國品質管理檢查，挑選檢驗船隻的準則包括船公司的表現評估、船舶的港口國監督檢查記錄、船齡和船隻類型、同一間船公司的船隻上次接受船旗國品質管理檢查的時間、檢驗和稽核記錄，以及船公司旗下的船舶涉及傷亡和意外的記錄。香港作為船旗國，由海事處承擔船旗國品質管理檢查程序的相關費用。

每次完成船旗國品質管理檢查後，海事處會與船公司和相關認可機構詳細討論。若檢查結果顯示船舶的技術管理有不足之處，船公司須接受船旗國品質管理系統稽核，並與相關認可機構和公司資深管理人員共同尋求改善方案。

海事處的電腦資料庫詳細記錄每艘船隻、管理公司和認可機構的資料。所有船旗國品質管理系統的檢查和稽核結果、港口國監督檢查記錄、檢驗記錄及其他相關細節亦會存檔，作為挑選接受檢查和稽核的船舶的準則。海事處會特別注意船齡較高、轉換了認可機構，以及在港口國監督檢查中符合較高目標因素值的船舶。

2003年起採用註冊前品質管理評估^[6]

香港船舶註冊處的遠洋船隻數量從1999年的174艘上升至2003年的547艘。確保這支快速增長的船隊的品質，是註冊處極為重要的工作。船舶在申請註冊時，必須符合國際海事組織的安全和污染防治標準。因此，海事處對擬申請香港船舶註冊的船舶進行註冊前的品質管理評估。

海事處在接獲船舶申請香港船舶註冊的申請後，會從各方來源搜尋該船的資料作調查，以評估船隻品質。評估重點包括：

• 船齡
• 船隻類型
• 過去三年港口國監督檢查的拘留次數
• 過去三年港口國監督檢查的不達標數目和比率（即每次港口國監督檢查的不達標數目平均數）
• 目前的註冊船旗國
• 目前的船級社
• 船隻的意外／事故記錄

因應上述標準，海事處會以既定準則為船隻評分，作為判斷船舶品質的一個公平指標。海事處會根據船舶和船公司的品質指標，決定是否需要對申請註冊的船隻進行註冊前品質管理檢查。如果該船不達標準，海事處會拒絕其註冊申請。

香港船舶註冊處的優勢

香港船舶註冊處的宗旨是吸引更多船運業務以香港作為據點。香港船舶註冊處不僅協助客戶註冊船舶，亦致力迅速有效地回應客戶的查詢。

整體而言，香港一直是進入中國門戶的熱門地點。許多著名的船東、船舶管理、金融業、保險業、航運經紀商及相關公司都在香港建立業務。

香港是信譽良好的船旗國，香港註冊船舶在全球的港口國監督扣留率甚低。國際運輸聯合會(International Transport Federation)並未將香港視為方便申請的船旗國。

香港法制健全可靠，當局在制訂政策和行政決策前，會諮詢有關業界意見，以順利落實法則和政策。

船舶註冊的成本和營運備受業界關注。香港船舶註冊處主要從兩方面協助船東和船舶經理人：第一，建立涵蓋香港船旗國所有服務的簡單收費結構；第二，在遇事時為船東和船舶經理人提供一個可以迅速反應的機制，以免除或縮短船舶滯留港口的時間。此外，香港船舶註冊處的註冊年費遠比其他船旗國低廉，船東和船舶經理人可免費或以低廉的費用使用政府服務，例如簽發貿易證明。

香港稅制簡單而且稅率低。香港註冊船舶在全球各地貿易所得的收益都無須在香港納稅，還可以在中國港口享有船舶噸稅優惠稅率。此外，香港註冊船舶處已與多個香港主要貿易夥伴簽訂雙重課稅協議。

船舶註冊和撤銷註冊的程序在兩個小時內即可完成。香港船舶註冊服務24小時運作，全年無休。船舶若在全球任何港口遇到問題，都可向香港政府求助。如船隻被無理扣留，不論船東和／或船舶經理人有否提出要求，香港政府都會主動跟進。

香港船舶註冊處僅接受高品質的船舶加入註冊。海事處會免費執行品質保證檢定，以確保註冊船舶符合香港的國際義務。船東和經理人亦可免費取得技術支援和建議。

香港船舶註冊處沒有對船員國籍設限。事實上，香港是全球唯一一個同時以英文和中文兩種官方語言編寫船員相關法律和出版刊物的註冊處，為香港的船東和經理人營造理想的營運環境。

在香港註冊的船舶可向世界各地的中華人民共和國大使館和領事館尋求協助。香港註冊船舶亦受中國人民解放軍海軍在亞丁灣的反海盜護航保護，而香港註冊的船舶佔接受中國海軍護航船隻總數的40%。選擇不接受艦隊護航的船隻，亦可以在有需要時向軍艦表明位置以尋求援助。

香港船舶註冊處於2002年提供「一站式」服務，方便客戶在船舶註冊與海員事務部的辦公室處理船舶註冊的申請及相關事宜，如無線電台執照申請和最低安全配員證書。這種「一站式」服務能為航運業提供更有效率和更高質素的服務。

美國有一個21世紀優質船舶計劃(QUALSHIP 21)，旨在獎勵保持船舶品質的船東，以減少不合標準的船舶進入美國港口。香港作為船旗國，亦獲得此計劃的資格認證。香港船隊具備優良的港口國監督紀錄，而且在美國海域亦擁有傑出的港口國監督紀錄，因此美國海岸防衛隊較少向處於美國水域的香港旗船舶進行港口國監督檢查。這也進一步說明，在香港註冊的船舶都由營運良好的公司管理，並獲相關船級社肯定擁有優良記錄。