由于海事训练学校提供的课程与海员训练中心及1988年成立的海事训练学院的课程重复，海事处于2000年停办海事训练学校。事实上，坊间有大量私人船公司或机构提供充足的海事课程，另一方面，政府当时亦计划大幅削减各部门的开支。其后，海事处认可私人训练课程。申请人只须通过官方认可的考试，即可取得所需的政府牌照。2000年，海事处成立海事处训练中心，在海事训练学校原址提供训练至今。^[27]

直至2013年，政府船队共有819艘船只，其中510艘为康乐及文化事务署辖下的船只，大部分为非机动船只（如海滩用的小艇和驳船）。警队辖下管有约130艘船只，包括36艘大型机动船、10艘大型高速船和38艘中型高速船，连同其他小型机动船（如机动子艇及充气救生船等），令警队成为拥有最多机动船只的政府部门。