海员训练中心(Seamen’s Training Centre)于2000年扩大训练课程的涵盖范围，加入适用于香港的海事工业安全港口法规。该中心除了因应特定要求提供专属课程外，也新增了有关安全事宜（如船上作业安全要求）的课程。一年后，海员训练中心取代航海训练学校(Nautical Training School)，为海事处人员提供训练课程。

由于海员训练中心的名称无法充分反映课程性质，该中心在2003年重新命名为海事训练学院，而其谘询委员会也由商船训练委员会(Merchant Navy Training Board)正式易名为海事服务业训练委员会(Maritime Services Training Board)。海事训练学院除了为中学毕业生提供综合训练之外，亦为在职海员提供有关航海业本地标准和国际要求的专业训练。

除提供训练外，海事训练学院亦协助安排毕业生在远洋船只、高速船和内河船上实习或就业。